地铁1号线（ Metro Line 1 ）：是中国江苏省南京市建成的第一条地铁线路，于2005年9月5日开工，于2010年7月1日开通北段，2010年11月24日开通南段，是南京市区的南北主干线，途经玄武区、秦淮区、建邺区和雨花台区，线路全长35.8千米，全部为地下线；共设置29座车站，全部为地下车站；列车采用6节编组A型列车 。
3号线（ Metro Line 3 ）：是中国江苏省南京市建成的第3条地铁线路，于2010年5月26日开工，于2015年4月1日开通高家冲站至柳洲东路站部分车站，于2015年12月6日开通整个3号线；是该市西北至东南方向的“L”放射性骨干线路，途经江北新区、鼓楼区、玄武区、秦淮区、雨花台区和江宁区，线路标识色为黄色 。
南京地铁S1号线（ Metro Line S1）：是南京市规划的城市轨道交通机场线，于2014年7月1日正式载客运营，是南京首条连接市区和机场的线路，线路南起正方中路站，北至南京南站；途经江宁经济开发区、禄口新城、禄口国际机场至南京南站，线路在南京南站与南京地铁1号线、3号线及机场线换乘 。
南京地铁S3号线（ Metro Line S3 ）：是南京首条跨市域的轨道交通线路，于2017年5月18日开通，线路北起南京雨花台区南京南站，途径江宁区，止于溧水区无想山站；途经南京南站、明觉路、溧水城东、大里东门、卧龙湖新城、中山湖、天山南路、滨河南路、水岸新都、无想山，是一条西南至东北走向的线路。线路由南京市浦口区行知路站向西引出，经浦珠路、柳州东路、南京绕城高速公路、南京长江大桥、长江南岸、大明路、苜蓿园大街、龙蟠中路、卡子门立交、双龙大道、吉印大道、诚信大道、机场高速至南京禄口国际机场。
